En virksomhed skal holde styr på indgående og udgående moms. Indgående moms er det moms du fakturere til dine kunder. Udgående moms er det moms du betaler når du køber ydelser eller vare til din virksomhed. Du skal som virksomhed afregne moms til Skat ud fra dit fakturaprogram. Indgående moms fratrukket udgående moms. Hvis dette er positivt skal du betale til Skat, modsat skal du have penge tilbage fra Skat. Man skal huske at det ikke er alle ydelser og vare hvor man kan trække moms fra i sit momsregnskab. Det er derfor vigtigt at du har lavet en kontoplan i dit regnskabsprogram, hvor du definere hvilke typer moms der er på de forskellige kontoer. Du kan med fordel benytte et online regnskabsprogram hvor din revisor kan opsætte en kontoplan for dig.